Les Micromammifères et les espèces cryptiques
Les micromammifères regroupent les taxons de rongeurs et de d’insectivores de petites tailles (i.e. pesant moins de 250g). On en compte environ 35 espèces en région Provence-Alpes-Côte d’Azur parmi lesquelles on retrouve les musaraignes, les campagnols, les mulots et autres souris, ou encore les taupes et la famille des gliridés (lérot, loir et muscardin).
Malgré leur rôle essentiel dans les écosystèmes, ces espèces, à la base des chaînes trophiques, restent méconnues et parfois mal-aimées. La connaissance naturaliste (répartition, biologie, phénologie) de ce groupe est jugée comme très lacunaire en région Provence-Alpes-Côte d’Azur (État de la connaissance naturaliste en PACA – Agence régionale de la biodiversité et de l’environnement de PACA). Cela est principalement dû au fait que l’observation et le suivi de ces espèces sont difficiles en raison de leur caractère nocturne (pour la plupart) et de leur petite taille.
Difficulté supplémentaire : certaines espèces sont très difficiles à différencier visuellement les unes des autres : on parle alors d’espèces cryptiques. Leur identification exacte nécessite alors des moyens plus développés, comme les d’analyses génétiques. Chez les micromammifères, ces espèces cryptiques représentent un tiers des espèces de métropole !
© Jean-Michel BOMPAR
Le Programme Espèces cryptiques
Afin d’améliorer la connaissance des espèces de micromammifères métropolitains, aussi bien pour leur taxonomie, que leur répartition ou les critères d’identification, la Société française d’étude et de protection des mammifères (SFEPM) a élaboré et coordonne un programme d’étude sur ces espèces cryptiques. Ce programme est national et multi-partenarial et implique la SFEPM, trois laboratoires de recherche (Université Claude Bernard (Lyon 1), Université de Bourgogne Europe et Muséum national d’histoire naturelle), ainsi que de nombreux participants, publics (Parc nationaux et régionaux, Office national des forêts, etc.) comme privées (associations, individuels).
Ce programme vise à obtenir des informations génétiques et morphométriques sur les espèces cryptiques. L’étude repose sur un protocole simple : la collecte opportuniste de cadavres frais de micromammifères et leur congélation, la saisie d’informations pertinentes (lieu, date, observateur et quelques mesures morphométriques) et le transfert de ces échantillons aux laboratoires de recherches. Ces derniers réalisent des analyses génétiques sur les spécimens afin de les identifier précisément et de mener à bien leurs études. L’ensemble des informations récupérées est ensuite diffusé aux participants ainsi qu’au grand public au travers du Système d’information de l’inventaire du patrimoine naturel (SINP).
Il est important de noter qu’aucun individu n’est sacrifié pour cette étude.
Les objectifs de ce programme sont multiples :
- améliorer la connaissance des micromammifères et de leur répartition ;
- chercher de nouvelles méthodes d’identification morphométrique des espèces cryptiques ;
- faire avancer la recherche scientifique (en fournissant du matériel biologique) en écologie, évolution et épidémiologie.
Déploiement au sein du Conservatoire d'espaces naturels Provence-Alpes-Côte d'Azur et relai régional
Les objectifs de ce programme étant en adéquation totale avec les missions du Conservatoire d’espaces naturels Provence-Alpes-Côte d’Azur, celui-ci a souhaité y participer. Le Conservatoire l’a ainsi déployé depuis 2026 à destination de ses salariés et de ses bénévoles. Ces derniers peuvent participer activement à la collecte de spécimens et donc à la connaissance régionale en enrichissant les bases de données du Conservatoire (Hélix) et du SINP régional : Silene.
Ce projet participe aux programme d’amélioration de la connaissance sur les mammifères, mise en place par la Conservatoire d’espaces naturels de Provence-Alpes-Côte d’Azur.
De plus, le Conservatoire s’est proposé d’être le relai régional de ce programme. Il coordonne ainsi les échanges de données et de spécimens entre les différents organismes mettant en place le programme en région (Parc national des Ecrins, Ligue de protection des oiseaux de PACA, etc.) et le coordinateur national de la SFEPM.
Pour plus d’information sur ce programme : https://www.sfepm.org/programme-especes-cryptiques.html
Si vous souhaitez participer, merci de contacter Yolan RICHARD, coordinateur régional du Programme Espèces cryptiques au Conservatoire d’espaces naturels de Provence-Alpes-Côte d’Azur – yolan.richard@cen-paca.org.
